Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn4Q9D6I3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms