Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdr42e1Q9D665 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sdr42e1Q9D665 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms