Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad1Q9D5T0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad1Q9D5T0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad1Q9D5T0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 658.6 ms