Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930449I24RikQ9D5E3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.28■■□□□ 1
4930449I24RikQ9D5E3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930449I24RikQ9D5E3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930449I24RikQ9D5E3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930449I24RikQ9D5E3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930449I24RikQ9D5E3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
4930449I24RikQ9D5E3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930449I24RikQ9D5E3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930449I24RikQ9D5E3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930449I24RikQ9D5E3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms