Protein–RNA interactions for Protein: Q9D542

4930470P17Rik, RIKEN cDNA 4930470P17, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930470P17RikQ9D542 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930470P17RikQ9D542 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4930470P17RikQ9D542 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4930470P17RikQ9D542 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930470P17RikQ9D542 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930470P17RikQ9D542 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4930470P17RikQ9D542 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930470P17RikQ9D542 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930470P17RikQ9D542 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930470P17RikQ9D542 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930470P17RikQ9D542 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930470P17RikQ9D542 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930470P17RikQ9D542 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930470P17RikQ9D542 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930470P17RikQ9D542 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms