Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam227bQ9D518 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms