Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
4930564D02RikQ9D4S4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4930564D02RikQ9D4S4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930564D02RikQ9D4S4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930564D02RikQ9D4S4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930564D02RikQ9D4S4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930564D02RikQ9D4S4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930564D02RikQ9D4S4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
4930564D02RikQ9D4S4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930564D02RikQ9D4S4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930564D02RikQ9D4S4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms