Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms