Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cfap53Q9D439 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms