Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933425L06RikQ9D3Z8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933425L06RikQ9D3Z8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
4933425L06RikQ9D3Z8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933425L06RikQ9D3Z8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms