Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms