Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pus10Q9D3U0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pus10Q9D3U0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pus10Q9D3U0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pus10Q9D3U0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pus10Q9D3U0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pus10Q9D3U0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms