Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag1Q9D3E6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms