Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasgef1cQ9D300 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1cQ9D300 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1cQ9D300 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1cQ9D300 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1cQ9D300 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1cQ9D300 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1cQ9D300 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1cQ9D300 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1cQ9D300 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgef1cQ9D300 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgef1cQ9D300 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgef1cQ9D300 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgef1cQ9D300 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms