Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D2Q3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms