Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc6bQ9D289 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms