Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Batf3Q9D275 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms