Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms