Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1N2

Gpihbp1, Glycosylphosphatidylinositol-anchored high density lipoprotein-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpihbp1Q9D1N2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gpihbp1Q9D1N2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpihbp1Q9D1N2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpihbp1Q9D1N2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms