Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cthrc1Q9D1D6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cthrc1Q9D1D6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cthrc1Q9D1D6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms