Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed3Q9D0L1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms