Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Mms19Q9D071 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Mms19Q9D071 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Mms19Q9D071 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Mms19Q9D071 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Mms19Q9D071 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Mms19Q9D071 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Mms19Q9D071 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Mms19Q9D071 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Mms19Q9D071 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Mms19Q9D071 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Mms19Q9D071 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Mms19Q9D071 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mms19Q9D071 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Mms19Q9D071 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms