Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3bQ9CZT8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms