Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms