Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmpcbQ9CXT8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms