Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX92

Gje1, Gap junction epsilon-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gje1Q9CX92 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gje1Q9CX92 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gje1Q9CX92 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gje1Q9CX92 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gje1Q9CX92 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gje1Q9CX92 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms