Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih4Q9CX13 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnih4Q9CX13 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnih4Q9CX13 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnih4Q9CX13 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnih4Q9CX13 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnih4Q9CX13 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnih4Q9CX13 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnih4Q9CX13 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnih4Q9CX13 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnih4Q9CX13 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnih4Q9CX13 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnih4Q9CX13 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms