Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
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RpainQ9CWY9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RpainQ9CWY9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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