Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxxc1Q9CWW7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cxxc1Q9CWW7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cxxc1Q9CWW7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cxxc1Q9CWW7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxxc1Q9CWW7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxxc1Q9CWW7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms