Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd3Q9CWR2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms