Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Atxn3Q9CVD2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atxn3Q9CVD2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms