Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cox16Q9CR63 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cox16Q9CR63 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cox16Q9CR63 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cox16Q9CR63 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cox16Q9CR63 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cox16Q9CR63 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cox16Q9CR63 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cox16Q9CR63 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cox16Q9CR63 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cox16Q9CR63 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cox16Q9CR63 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cox16Q9CR63 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cox16Q9CR63 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cox16Q9CR63 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cox16Q9CR63 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cox16Q9CR63 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cox16Q9CR63 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms