Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ska2Q9CR46 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ska2Q9CR46 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ska2Q9CR46 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ska2Q9CR46 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ska2Q9CR46 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms