Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms