Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd5Q9CQP3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd5Q9CQP3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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