Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Mrpl35Q9CQL6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl35Q9CQL6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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