Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DenrQ9CQJ6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DenrQ9CQJ6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms