Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl11Q9CQF0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms