Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nipsnap3bQ9CQE1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 554.6 ms