Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms