Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sar1bQ9CQC9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms