Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl49Q9CQ40 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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