Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms