Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms