Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt88Q9CPR6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms