Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GpnmbQ99P91 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms