Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b1Q99NB9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms