Protein–RNA interactions for Protein: Q99N43

Kremen1, Kremen protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kremen1Q99N43 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kremen1Q99N43 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kremen1Q99N43 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kremen1Q99N43 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.8 ms