Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Prss29Q99MS4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Prss29Q99MS4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prss29Q99MS4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prss29Q99MS4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss29Q99MS4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prss29Q99MS4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss29Q99MS4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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Prss29Q99MS4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prss29Q99MS4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss29Q99MS4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Prss29Q99MS4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Prss29Q99MS4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prss29Q99MS4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prss29Q99MS4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prss29Q99MS4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prss29Q99MS4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Prss29Q99MS4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prss29Q99MS4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prss29Q99MS4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Prss29Q99MS4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Prss29Q99MS4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Prss29Q99MS4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prss29Q99MS4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Prss29Q99MS4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prss29Q99MS4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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