Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SrrtQ99MR6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms